77 leitos distribuídos em 6 alas de internação, que ocupam dois andares do hospital.

Cada ala é composta por 9 quartos e 1 posto de enfermagem, dispostos em formato de roseta, cuja área central é reservada ao corpo médico, à enfermagem e aos pais. Paredes de vidro separam o quarto da criança do quarto dos acompanhantes/visitantes.

As visitas são bem-vindas a qualquer hora, desde que permaneçam no quarto dos pais. Para ter contato com a criança, o visitante passa por uma higienização nas pias externas, a fim de evitar infecções nos organismos já debilitados.

Graças a esses cuidados, os índices de infecção hospitalar são bastante reduzidos. O período médio de internação é de 5 dias, estendendo-se apenas nos casos mais graves.

Um motivo de orgulho para o Boldrini é o fato de quartos de convênios privados e os subsidiados pelo Sistema Único de Saúde (SUS) oferecerem o mesmo padrão de conforto aos pacientes.